Die BayCEER EDV und die BayCEER Geschäftsstelle sind zwei von vier Serviceeinrichtungen des Zentrums.
Die BayCEER EDV hat neben allgemeinen IT Dienstleistungen einen Schwerpunkt in Datenbanken und Webservices. Als Beispiele für die Arbeit der Arbeitsgruppe werden der Webauftritt des Deutschen Geographentags 2007 sowie die Messdatenbank des BayCEER vorgestellt.
Die BayCEER Geschäftstelle übernimmt viele Aufgaben aus dem Bereich Wissenschaftsmanagement und -marketing. Diese reichen vom Betrieb der Messflächen und der Bereitstellung von Infrastruktur bis zur Unterstützung bei der Antragsstellung, Organisation von Tagungen und Darstellung der am BayCEER geleisteten Forschungsarbeit in der Öffentlichkeit.