Towards an integrative and comprehensive standard for meta-omics data of collection objects (MOD-CO)

DFG RA 731/16-1

Von 05/2014 bis 12/2017

Projektleiter: Gerhard Rambold

Für die Hinterlegung molekularer Sequenz- und Arraydaten existiert bereits eine Anzahl von Stan-dards. Jedoch fehlt ein umfassend ausgearbeiteter Standard (Schema, Vokabularien) für die Zuord-nung aller Arten von -omics-Daten zu Belegmaterial in naturhistorischen Sammlungen und Kultur-sammlungen. Ziel des Projektes ist es, relevante Deskriptoren aus einer Vielzahl von Analyseprotokol-len zu extrahieren um auf dem Hintergrund der verschiedenartigen Methoden eine Standardisierung zu erreichen und dabei eine strukturelle Redundanz zu vermeiden. Des Weiteren sollen relevante De-skriptoren aus verschiedenen anderen Datendomänen exzerpiert und dem neuen konzeptionellen Schema zugeordnet werden. Basierend auf existierenden Konzepten und Standards sollen integrati-ve, kontrollierte Vokabularien erarbeitet werden, um das gesamte Spektrum von Beobachtungs- und Messdaten wie auch die prozeduralen Schritte im Zusammenhang mit einer meta-omics-Charakterisierung von Umweltproben zu beschreiben. Schema und Vokabularien werden beispielhaft in den beiden Datenamagement-Systemen Diversity Workbench und SILVA/megx.net implementiert und in Zusammenarbeit mit den TDWG- und GSC-Kommittees zur Standardisierung veröffentlicht.

Homepage: http://www.mod-co.net